蓄电池电机车的能量来源，但随着使用时间的增加，蓄电池不可避免的会出现一些问题。常见的问题有不平衡、极板硫化、短路、开路。

其中短路与开路的处理相对简单，用仪表检测出短路或开路的地方。短路的地方通过打孔等方法，进行清理，将导致短路的铅粉等清理干净。而开路则直接焊接好即可如果蓄电池出现不平衡的现象，也就是单体电池的一致性下降，则需要找出容量、内阻、自放电速度等差别比较大单体电池，再进行更换。

而极板硫化常见的处理方法是先将电解液倒出，并且用蒸馏水进行冲洗。然后加入蒸馏水与硫酸盐，再充放电几次。最后将蓄电池内的液体倒干净，并加入新的电解液。